MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 1787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	TCT	2	6	39	44	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018659	CAGA	2	8	75	82	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018659	TGT	2	6	206	211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018659	GTG	2	6	213	218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018659	ATG	2	6	306	311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018659	GCC	2	6	345	350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018659	GCT	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018659	TTC	2	6	417	422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018659	CCG	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018659	CCGC	2	8	564	571	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_018659	TG	3	6	588	593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018659	GTA	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018659	CTG	2	6	670	675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018659	CAGG	2	8	688	695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018659	TCTG	2	8	729	736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018659	ACG	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018659	TCT	2	6	917	922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018659	TCA	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018659	GCCA	2	8	984	991	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018659	AG	3	6	1286	1291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018659	CTGT	2	8	1355	1362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018659	CAA	2	6	1396	1401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018659	AGG	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018659	T	7	7	1525	1531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018659	GAA	2	6	1558	1563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018659	ATCA	2	8	1566	1573	50 %	25 %	0 %	25 %	407484677
27	NC_018659	T	6	6	1582	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	407484677
28	NC_018659	ATGA	2	8	1589	1596	50 %	25 %	25 %	0 %	407484677
29	NC_018659	T	6	6	1629	1634	0 %	100 %	0 %	0 %	407484677
30	NC_018659	G	6	6	1658	1663	0 %	0 %	100 %	0 %	407484677
31	NC_018659	CGA	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484677
32	NC_018659	AG	3	6	1747	1752	50 %	0 %	50 %	0 %	407484677
33	NC_018659	ACG	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484677
34	NC_018659	TGGA	2	8	1833	1840	25 %	25 %	50 %	0 %	407484677
35	NC_018659	TGC	2	6	1873	1878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484677
36	NC_018659	CAGA	2	8	2031	2038	50 %	0 %	25 %	25 %	407484677
37	NC_018659	CAC	2	6	2115	2120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484677
38	NC_018659	TTAAC	2	10	2127	2136	40 %	40 %	0 %	20 %	407484677
39	NC_018659	TTA	2	6	2153	2158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484677
40	NC_018659	GT	3	6	2169	2174	0 %	50 %	50 %	0 %	407484677
41	NC_018659	GCA	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484677
42	NC_018659	GTT	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484677
43	NC_018659	TTCCGG	2	12	2278	2289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484677
44	NC_018659	CCT	2	6	2298	2303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484677
45	NC_018659	ATG	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484678
46	NC_018659	TCG	2	6	2501	2506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484678
47	NC_018659	CCT	2	6	2545	2550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_018659	TCA	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484679
49	NC_018659	GATA	2	8	2690	2697	50 %	25 %	25 %	0 %	407484679
50	NC_018659	CCAG	2	8	2706	2713	25 %	0 %	25 %	50 %	407484679
51	NC_018659	C	6	6	2720	2725	0 %	0 %	0 %	100 %	407484679
52	NC_018659	T	6	6	2738	2743	0 %	100 %	0 %	0 %	407484679
53	NC_018659	TGAT	2	8	2797	2804	25 %	50 %	25 %	0 %	407484679
54	NC_018659	GCA	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484679
55	NC_018659	CAT	2	6	2891	2896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484679
56	NC_018659	AGC	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484679
57	NC_018659	GCG	2	6	2967	2972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484679
58	NC_018659	GCC	2	6	2982	2987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484679
59	NC_018659	AT	3	6	3025	3030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018659	A	7	7	3051	3057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018659	AGA	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484680
62	NC_018659	CAG	2	6	3082	3087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484680
63	NC_018659	CGAT	2	8	3101	3108	25 %	25 %	25 %	25 %	407484680
64	NC_018659	CAG	2	6	3115	3120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484680
65	NC_018659	TGC	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484680
66	NC_018659	CAG	3	9	3279	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484680
67	NC_018659	ACCGG	2	10	3440	3449	20 %	0 %	40 %	40 %	407484680
68	NC_018659	CTG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484680
69	NC_018659	TCA	2	6	3582	3587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484680
70	NC_018659	TGA	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484681
71	NC_018659	CAC	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484681
72	NC_018659	TAC	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484681
73	NC_018659	GAC	2	6	3754	3759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484681
74	NC_018659	T	7	7	3761	3767	0 %	100 %	0 %	0 %	407484681
75	NC_018659	ATT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484681
76	NC_018659	GGC	2	6	3830	3835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484681
77	NC_018659	ATC	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484681
78	NC_018659	TTC	2	6	3876	3881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484681
79	NC_018659	T	6	6	3886	3891	0 %	100 %	0 %	0 %	407484681
80	NC_018659	T	6	6	3947	3952	0 %	100 %	0 %	0 %	407484681
81	NC_018659	TCT	2	6	4003	4008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484681
82	NC_018659	TGA	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484681
83	NC_018659	TG	3	6	4060	4065	0 %	50 %	50 %	0 %	407484681
84	NC_018659	CAT	2	6	4094	4099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484681
85	NC_018659	GTT	2	6	4303	4308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
86	NC_018659	CAT	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484682
87	NC_018659	GTT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
88	NC_018659	CGT	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
89	NC_018659	CAA	2	6	4462	4467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484682
90	NC_018659	ACC	2	6	4565	4570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484682
91	NC_018659	CAC	2	6	4594	4599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484682
92	NC_018659	CCT	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484682
93	NC_018659	CCA	2	6	4852	4857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484682
94	NC_018659	AT	3	6	4959	4964	50 %	50 %	0 %	0 %	407484682
95	NC_018659	TGC	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
96	NC_018659	TGT	2	6	5069	5074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
97	NC_018659	TGGT	2	8	5110	5117	0 %	50 %	50 %	0 %	407484682
98	NC_018659	TAC	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484682
99	NC_018659	GCT	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
100	NC_018659	TCC	2	6	5199	5204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484682
101	NC_018659	TGC	2	6	5249	5254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
102	NC_018659	TGT	2	6	5259	5264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
103	NC_018659	ATT	2	6	5324	5329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484682
104	NC_018659	CCG	2	6	5412	5417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484682
105	NC_018659	TGC	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
106	NC_018659	GCC	3	9	5492	5500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484682
107	NC_018659	GAT	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484682
108	NC_018659	TTTC	2	8	5540	5547	0 %	75 %	0 %	25 %	407484682
109	NC_018659	AGT	2	6	5633	5638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484683
110	NC_018659	GAAC	2	8	5720	5727	50 %	0 %	25 %	25 %	407484683
111	NC_018659	GGA	2	6	5810	5815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484683
112	NC_018659	CAT	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484683
113	NC_018659	TGGT	2	8	5889	5896	0 %	50 %	50 %	0 %	407484683
114	NC_018659	GAC	2	6	5922	5927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484683
115	NC_018659	AGG	2	6	6109	6114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484683
116	NC_018659	CAC	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484683
117	NC_018659	GTT	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484683
118	NC_018659	AG	3	6	6227	6232	50 %	0 %	50 %	0 %	407484683
119	NC_018659	ACA	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484683
120	NC_018659	CGG	2	6	6318	6323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484683
121	NC_018659	GCAG	2	8	6380	6387	25 %	0 %	50 %	25 %	407484683
122	NC_018659	TCG	2	6	6462	6467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484683
123	NC_018659	GTGC	2	8	6476	6483	0 %	25 %	50 %	25 %	407484683
124	NC_018659	GGC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484683
125	NC_018659	ATC	2	6	6603	6608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484684
126	NC_018659	TCT	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484684
127	NC_018659	GAG	2	6	6906	6911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484684
128	NC_018659	CAT	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484684
129	NC_018659	GCTG	2	8	6999	7006	0 %	25 %	50 %	25 %	407484684
130	NC_018659	TTG	2	6	7009	7014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484684
131	NC_018659	GAC	2	6	7030	7035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484684
132	NC_018659	AAG	2	6	7112	7117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484684
133	NC_018659	ATT	2	6	7160	7165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484684
134	NC_018659	TTCA	2	8	7309	7316	25 %	50 %	0 %	25 %	407484685
135	NC_018659	GTC	2	6	7366	7371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484685
136	NC_018659	T	7	7	7404	7410	0 %	100 %	0 %	0 %	407484685
137	NC_018659	GACA	2	8	7418	7425	50 %	0 %	25 %	25 %	407484685
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142	NC_018659	T	6	6	7667	7672	0 %	100 %	0 %	0 %	407484686
143	NC_018659	CCTG	2	8	7673	7680	0 %	25 %	25 %	50 %	407484686
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398	NC_018659	ATG	2	6	20885	20890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484697
399	NC_018659	TTA	2	6	20977	20982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484697
400	NC_018659	CCA	2	6	21007	21012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484697
401	NC_018659	TCC	2	6	21060	21065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484697
402	NC_018659	ATAA	2	8	21081	21088	75 %	25 %	0 %	0 %	407484697
403	NC_018659	TAT	2	6	21215	21220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484697
404	NC_018659	ATG	2	6	21248	21253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484697
405	NC_018659	CCG	2	6	21340	21345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484697
406	NC_018659	TGT	2	6	21359	21364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484697
407	NC_018659	AGCC	2	8	21424	21431	25 %	0 %	25 %	50 %	407484697
408	NC_018659	AACC	2	8	21451	21458	50 %	0 %	0 %	50 %	407484697
409	NC_018659	ATT	2	6	21459	21464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484697
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411	NC_018659	CAC	2	6	21704	21709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484697
412	NC_018659	AT	3	6	21826	21831	50 %	50 %	0 %	0 %	407484697
413	NC_018659	CCA	2	6	21832	21837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484697
414	NC_018659	CCA	2	6	21895	21900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484697
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419	NC_018659	T	6	6	22260	22265	0 %	100 %	0 %	0 %	407484697
420	NC_018659	CTT	2	6	22348	22353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484698
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432	NC_018659	A	6	6	22818	22823	100 %	0 %	0 %	0 %	407484698
433	NC_018659	AAT	2	6	22853	22858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484698
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439	NC_018659	TAC	2	6	23217	23222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484699
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452	NC_018659	TG	3	6	23630	23635	0 %	50 %	50 %	0 %	407484700
453	NC_018659	TTG	2	6	23690	23695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484700
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475	NC_018659	CAC	2	6	24691	24696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484701
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